種類株式はいつ普通株式に転換すれば良いですか。

種類株式を発行したまま、普通株式の上場を行うことはほぼ困難です。

したがって、種類株式は申請前に普通株式に転換してください。
申請前に転換を行うことから、VC等から資金調達を種類株式で行う際には、上場準備会社側からの要請により普通株式に転換できるよう転換条項を盛り込んでおく必要があります。